段力辉团队开发OpenFISH技术实现同一切片空间转录组与质谱成像联合分析
科研进展 | 段力辉团队开发OpenFISH技术实现空间组织原位“转录-代谢”联合分析
中国科学院遗传与发育生物学研究所段力辉研究组在Neuron发表论文，提出OpenFISH技术，可在同一切片上完成空间转录组与MALDI质谱成像（MALDI-MSI）的整合分析。原文将该方法应用于阿尔茨海默病研究，用于探索细胞类型相关代谢物的变化。
发生了什么
2026年9月29日，中国科学院遗传与发育生物学研究所段力辉研究组在Neuron发表论文，介绍名为OpenFISH的技术，能够在同一张组织切片上把空间转录组检测与MALDI质谱成像（MSI）整合起来，实现原位的转录-代谢联合分析。团队将该方法应用于阿尔茨海默病（AD）研究，用来考察与细胞类型相关的代谢物变化。材料未披露具体检出了哪些代谢物或涉及哪些细胞类型。
为什么重要
空间转录组能回答某个位置是什么细胞、在表达什么基因，MALDI-MSI能回答同一区域存在哪些代谢物，但要让两套信号逐点对应，空间配对一直是方法学上的难点；论文标题里的same-section（同切片）表明，这项技术的核心就是把两类数据落到同一张切片、同一套空间坐标上。打通之后，AD研究中观察到的代谢物变化就能挂到具体细胞类型上，而不是停留在区域层面的笼统描述。对做空间组学方法开发、神经退行性疾病代谢机制研究的人，以及关注代谢通路靶点的研发读者，这是一条可直接迁移的技术路线。
还缺什么
材料没有披露几项关键信息：AD部分的具体结果（差异代谢物是什么、对应哪些细胞类型、样本来自人还是动物模型）、方法性能指标（分辨率、通量、质谱步骤对FISH信号或后续检测的影响），以及protocol和代码是否公开——技术名里的Open是否意味着开源开放，待确认。下一步看论文原文的数据与方法部分，再看该技术是否从AD推广到其他组织或疾病场景。
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