单细胞生理药代动力学(scPBPK)模型介绍
Introduction to Single-Cell Physiologically-Based Pharmacokinetic (scPBPK) Models
Saini A 与 Gallo JM 提出单细胞生理药代动力学(scPBPK)模型,通过表达依赖(ED)权重函数(采用负二项分布)刻画细胞尺度药代异质性,可与现代组学技术对接。AZD1775(三项 ED 血脑屏障转运)模拟显示显著单细胞浓度异质性,midazolam(肝细胞 ED 代谢)则因膜转运远高于代谢未呈现该异质性。scPBPK 模型有望扩展至药效学建模。
生理药代动力学(PBPK)模型在过去十余年里已成为药物研发和监管审评中的重要工具。系统综述显示,2008年至2015年间相关文献数量稳步上升,应用集中于CYP450和转运体底物以及抑制剂、诱导剂的建模 [1];美国FDA也已在2008至2010年受理的IND和NDA审评中,用PBPK辅助判断是否需要开展特定临床药理学研究、确定试验设计和说明书措辞 [2],并专门就PBPK支持剂量选择举办公开研讨会 [4];制药工业界则将这一方法嵌入从发现到开发的各个阶段 [5]。然而,这些模型对药物处置的刻画基本停留在组织、器官水平,而药物代谢酶和转运体的表达量在单个细胞之间存在差异,这种细胞尺度的异质性正是标准PBPK框架难以直接呈现的,也是向更细尺度建模时卡住的地方。
发表于CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol的这项研究提出了单细胞PBPK(scPBPK)模型,尝试在细胞尺度上考察药物处置。从标准PBPK过渡到scPBPK,关键在于刻画表达依赖(ED)过程,如代谢或膜转运:这些过程借助权重函数——可以是人为设定或数据驱动的分布——使每个细胞呈现不同的动力学。作者给出两个示例:一是药物AZD1775,涉及三个经血脑屏障的ED转运过程;二是咪达唑仑,仅有肝细胞代谢这一个ED过程。两个示例中各ED过程的权重函数均采用scRNAseq分析中常用的负二项分布。模拟结果显示,AZD1775的单细胞药物浓度呈现很大异质性,而咪达唑仑则没有,原因在于其膜转运相对代谢过快,细胞间差异被削弱。
相对于已有认识,这项工作的推进在于把PBPK从预测人体整体和组织暴露的层面 [2] 下沉到单个细胞,并使模型与现代组学技术兼容——权重函数可以直接借用单细胞转录组分析中惯用的分布形式,为表达数据进入药代模型提供了通路。传统PBPK与药效学耦合的建模流程已有成熟范式 [3],本文进一步设想scPBPK可向药效学模型拓展,这与此前剂量选择、监管决策等应用方向 [4][5] 形成了互补,把问题从“组织里平均有多少药”推进到“每个细胞里有多少药”。
当然,目前的结论仅基于两个示例药物的模拟,权重函数统一取负二项分布,异质性的大小又高度依赖于ED过程与膜转运的相对强弱,这一框架能否推广到更多药物、组织和过程尚待检验;向药效学模型的拓展目前也只是一种展望,还没有实际的建模实例来验证。
- 1.Physiologically Based Pharmacokinetic (PBPK) Modeling and Simulation Approaches: A Systematic Review of Published Models, Applications, and Model Verification · Drug Metab Dispos 2015
- 2.Applications of physiologically based pharmacokinetic (PBPK) modeling and simulation during regulatory review · Clin Pharmacol Ther 2011
- 3.Applied Concepts in PBPK Modeling: How to Build a PBPK/PD Model · CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol 2016
- 4.Application of Physiologically Based Pharmacokinetic (PBPK) Modeling to Support Dose Selection: Report of an FDA Public Workshop on PBPK · CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol 2015
- 5.Physiologically based pharmacokinetic modeling in drug discovery and development: a pharmaceutical industry perspective · Clin Pharmacol Ther 2015
来源:文献与产业新闻 · pubmed.ncbi.nlm.nih.gov