专家解读（YouTube）· iBiology Techniques · YouTube·2026-10-14 00:00· 4 天前评分52

CellProfiler 开源显微图像分析软件方法介绍（Anne Carpenter 讲座）

CellProfiler图像分析软件（Anne Carpenter）

导读

CellProfiler 是 Broad Institute 开发的免费开源显微图像分析软件，支持 Windows/Mac/Linux，通过 Bio-Formats 可读取超过 180 种显微镜文件格式，以模块化流水线实现预处理、细胞识别与形态学测量。

要点概括

介绍Broad Institute开发的免费开源显微图像分析软件CellProfiler及其模块化分析与分类流程。

CellProfiler由Broad Institute生物学家（讲者）编写初版，免费开源，支持Windows/Mac/Linux，借助Bio-Formats可读>180种显微镜文件格式。
分析为模块化pipeline：先预处理（多通道分色、校正照明/illumination伪影），再识别结构（细胞核、细胞边界），最后测量数量/大小/形状/纹理/荧光强度/空间关系等。
可于本地笔记本或计算集群/云端大规模自动运行；配套CellProfiler Analyst支持'数据点与图像联动'的探索可视化及表型自动分类。
Analyst的classifier通过拖放标注少量细胞表型，机器学习随标注逐步训练，最终可自动对数百万至数十亿细胞打分分类。
讲者实验室正与全球合作开发基于深度学习的网页版图像分类工具。
定位面向日常bench生物学家，填补先进计算方法与实验人员间的鸿沟，并提供image.sc在线社区论坛支持。
定位：方法(成像/计算)（iBiology Techniques）；非 AI。