碱基编辑与先导编辑:从工程蛋白到临床(David Liu)
David Liu 在 CSHL Leading Strand 讲座中讲解碱基编辑与先导编辑,两类工程化蛋白可在不产生双链断裂的前提下定点修改 DNA。讲座提及截至演讲已有 ≥23 项相关临床试验,2023 年末首个体内碱基编辑结果出炉,FDA 近期批准首个先导编辑临床试验。
David Liu 讲碱基编辑(base editing)与先导编辑(prime editing):两类工程化蛋白可指定性修改 DNA(无需双链断裂或供体模板),并已进入大量临床试验。
- 两类工具:base editing 与 prime editing 是工程化/进化蛋白,可指定性修改 DNA(无需双链断裂或供体模板)。
- 临床突破:截至演讲已有 ≥23 项临床试验用 base/prime editor;2023 末首个体内 base editing 结果公布;FDA 近期批准首个 prime editing 临床试验。
- 案例:2022 年一名患者接受含 3 个碱基编辑的 CAR-T 治疗 T 细胞白血病,完全缓解;CGD 患者造血干细胞编辑与植入。
- 患者特异性:可为单例患者定制基因编辑疗法(如 KJ Mulun 尿素循环病,由提前终止密码子引起);一个 prime editor 可部分拯救多个模型。
- 脱靶:用两种全基因组脱靶检测方法验证 prime editor 安全性。
- 定位:基因编辑(非 AI);与 #41(类器官)、#43(慢病毒基因治疗)互补的基因治疗主题。
发生了什么
David Liu 在 CSHL Leading Strand 的53分钟讲座中讲解碱基编辑与先导编辑两类工程化蛋白,它们可以在不造成双链断裂、不需要供体模板的情况下定点修改 DNA。截至演讲,已有至少23项采用 base/prime editor 的临床试验;材料称2023年末公布了首个体内碱基编辑的临床结果,FDA 近期批准了首个先导编辑临床试验。案例上,2022年一名 T 细胞白血病患者接受含3个碱基编辑的 CAR-T 治疗后完全缓解,CGD 患者的造血干细胞也完成了编辑与植入。
为什么重要
这场讲座回答了领域里一个悬而未决的问题:基因编辑能否绕开双链断裂和供体模板这两个风险与操作瓶颈——至少23项试验进入临床说明工程化路线已经走到人体,而且可以为单例患者定制,KJ Mulun 的尿素循环病(提前终止密码子所致)就是单患者定制疗法的实例。对研发和 BD 有用的点在平台属性:一个 prime editor 能部分拯救多个模型,意味着同一套工具有横向覆盖多个适应症的潜力,而不是一个分子一个适应症。用两种全基因组脱靶检测方法验证 prime editor 的安全性,直接回应了监管最关心的脱靶风险问题,这也是这类资产能否持续进临床的核心门槛。
还缺什么
材料没有披露这23项试验的适应症分布、给药方式和具体疗效数据,2023年末体内碱基编辑结果的细节也待读出。KJ Mulun 定制疗法的疗效、持续时间以及单患者疗法的监管路径均未披露,prime editor 所用两种脱靶检测方法的具体名称和灵敏度待确认。下一步盯 FDA 批准的先导编辑试验何时给药、读出什么数据,以及三重碱基编辑 CAR-T 与 CGD 造血干细胞编辑的长期随访结果——目前均待确认。
这篇讲座梳理了碱基编辑与先导编辑的临床落地数量与首例案例,并对比了两类工具的脱靶检测方法,有助于理解其当前临床边界。
来源:专家解读(YouTube) · youtube.com