空间转录组学工具清单：按分析步骤编排340条目，链接与DOI逐一核对

帖主（u/rui-123）在r/bioinformatics分享自建的"空间转录组学工具清单"（GitHub: awesome-spatial-transcriptomics），按分析流程（技术→分割→空间可变基因→解卷积→对齐/3D→细胞通信→超分辨→时空建模→可视化）编排，称已逐一核对340个条目的链接与DOI。评论以建设性补充为主：u/Select-Run-2301（14▲）赞"按分析步骤而非字母排序"更实用；u/Latter_Plankton_8440（7▲）推荐定量空间分析工具包MuSpAn并提及其与squidpy的指标差异；帖主当场采纳建议增列hdWGCNA、SpatialCorr等。事实层面，该清单为社群维护的二级资源（🔗），所引cell2location、squidpy、MuSpAn均为真实存在的生信工具；清单质量与完整性属社区共识，非同行评审结论。对入行者的导航价值高，但不构成方法学权威。

核验　🔗 需回查：社群维护的GitHub二级资源（awesome-spatial-transcriptomics）；cell2location/squidpy/MuSpAn为真实生信工具。清单质量属社区共识，非同行评审。