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文献与产业新闻· Nature Biotechnology·· 2026-08-19评分31

从读取到写入:DNA 写入技术迈入快速创新期

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导读

DNA 写入正进入快速创新期,酶法和细胞方法挑战沿用数十年的化学合成路线,但尚无技术能在生物学所需规模下实现长链且高保真写入。持续进展有望突破该领域最持久的瓶颈之一,使当前无法开展的实验成为可能。

深度解读

当测序与基因组编辑能力快速提升时,从头“写”DNA的能力却长期是短板,产出长而复杂的合成DNA一直落后于读取和编辑DNA[6]。数十年来,寡核苷酸合成几乎完全依赖亚磷酰胺化学,这条路线直接合成的长度被限制在约200个碱基,还会产生有害废物[2]。为拼出更长的序列,研究者发展出一系列设计与组装工具:DNAWorks可根据目标蛋白的氨基酸序列自动设计密码子优化、解链温度均一的寡核苷酸,配合两步PCR完成基因合成[4];DNA assembler则借助酵母体内同源重组,一步组装出约19 kb、含八个基因的代谢途径,效率达70%–100%[5]。而需求端只增不减——天然产物的生物合成途径常由数十个基因构成、横跨基因组大片区域[1],Sc2.0等项目更尝试按设计原则合成部分真核染色体[3]。供给始终追不上需求,合成技术的局限因此被公认为合成生物学的基本瓶颈[7]。

2026年8月19日在线发表于Nature Biotechnology的这篇文章,把这些散落的进展收拢成一幅“从读到写”的图景:DNA写入正在进入快速创新期,酶法与细胞法路线正在挑战延续数十年的化学合成。所谓酶法,其技术源头是TdT–dNTP偶联物,每次延伸可在10–20秒内定量加入一个碱基,并可循环迭代写出指定序列[2];所谓细胞法,可以分子自组装诱导克隆为代表,它把体外正交自组装与宿主细胞的DNA修复机器耦合,借助芯片寡核苷酸合成,在一锅反应中产出超过1000种不同的基因片段[7];在组装层面,Sidewinder用DNA三向接头把指导组装的信息与最终序列解耦,完成40个片段的组装,并攻克高GC、高重复等难缠序列[6]。

这篇文章的推进主要在判断与定位,而非新方法本身。它明确指出转折正在发生——新生路线已足以对老牌化学构成实质挑战;同时保持清醒——目前还没有任何一条路线能在生物学最终所需的规模上交付长而准确的DNA。换句话说,“从读到写”的转变已经开始,但远未完成。这一判断与“合成能力落后于测序和编辑”的诊断[6]以及“基本瓶颈”的表述[7]相互呼应,把零散的技术进步放上同一条主线,并预示瓶颈一旦移除,许多目前无从下手的实验将成为可能。

局限也写在文章自己的表述里:长、准、大三者尚不能兼得,瓶颈只是“有望”被移除而非已被移除,酶法与细胞法要真正接替化学合成,仍需在长度、精度与规模上继续证明自己。

来源:文献与产业新闻 · nature.com