顶刊论文(社媒热度)· Nature·· 16 天前精选评分54
Gen-COMPAS:生成式构象过渡采样框架突破分子模拟时间尺度限制
Breaking timescales with generative sampling of conformational transitions.
导读
研究团队开发了Gen-COMPAS生成式承诺子引导路径采样框架,无需预定义集体变量即可重建分子过渡路径。该方法结合去噪扩散概率模型和承诺子过滤,在纳秒至亚微秒尺度生成过渡态集合,相比传统方法大幅减少计算采样需求。应用于从迷你蛋白到五聚体配体门控离子通道等多个系统,仅从已知端点结构即可恢复承诺子、过渡态和自由能景观。
推荐理由
该方法无需预定义反应坐标即可重建分子过渡路径,为研究蛋白质折叠和膜转运等生物过程提供了计算可行的新途径。
来源:顶刊论文(社媒热度) · doi.org