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bioRxiv预印本发表CIPI:长读单细胞RNA新异构体通路分析框架

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Synthesis

2026年10月15日,bioRxiv Genomics板块发表了一篇题为《超越基因:通过通路分析在长读单细胞RNA测序中解读新异构体功能语境》的预印本文章。作者开发了名为CIPI(Centroid-based Isoform Pathway Inference,基于质心的异构体通路推断)的计算框架,针对长读单细胞RNA测序数据,以细胞类型表达模式为依据构建表达邻域。该框架可结合GO、KEGG或Reactome等通路数据库,将新发现的基因与异构体锚定到对应的功能通路中。作者指出,CIPI能够为目前尚未获得注释的新异构体提供可生成假设的优先级排序依据,使研究者在长读测序背景下能够从功能语境角度解读新异构体的潜在作用。

Written by a model from the reports · updated 2 hours ago

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Oct 15
  1. bioRxiv Genomics
    超越基因:通过通路分析在长读单细胞RNA测序中解读新异构体功能语境

    作者开发了名为 CIPI(Centroid-based Isoform Pathway Inference)的计算框架,在长读单细胞 RNA 测序数据中以细胞类型表达模式为依据构建表达邻域。结合 GO、KEGG 或 Reactome 等通路分析,该框架可将新发现的基因与异构体锚定到功能通路中,为尚未注释的新异构体提供可生成假设的优先级排序依据。

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